Кажется я понимаю ваш ход рассуждения. Значит, должно было произойти примерно следующее:

"И создал Он Х хромосому, и соединил их парой, и вышла женщина"
"И подумал Он: плохо женщине одной, и, взяв у неё Х хромосому, сотворил Y хромосому."
"И соединил их, и получился мужчина."

Ну, а я, допустим, исходил из соскабливания масла с хлеба. В конце концов, история о том, как физики и математики кипятят воду, вам, должно быть, знакома. Если уж говорить о творении а не эволюции, так не всё равно ли с какого конца? Если же говорить о нелогичности: certum est, quia impossibile. Богу совершенно не обязательно подчиняться логике созданного Им мира, тем более человеческой.