Прежде всего, неплохо бы выяснить, как менялось отношение к запаху экскрементов во времени и в разных культурах. Изначально это, возможно, было связано со скученным существованием в пещерах и землянках, где грязь могла способствовать инфекциям. Группы "чистюль" получали эволюционное преимущество.
Ваш пример с животными не совсем понятен. Во всяком случае, механизм, помогающий приучать не гадить где попало, у них другой: не оставлять на открытом месте своих запахов. Вы, наверное, замечали у некоторых собак рудимент инстинкта забросать испражнения землей? Они делают задними ногами несколько чисто символических движений, как бы забрасывая несуществующей землей то, что навалили.
Но и опять же: существен элемент именно приучения. Если не приучать, они, скорее всего, будут гадить где придется, т.к. дикие инстинкты у них ослаблены многими поколениями одомашнивания.