Думаю, потому что человек лежит во сне на спине, например, в одном положении. И кровь немного застаивается в задней части тела. Вот чтобы ее "разогнать" он шевелит мышцами. Например, в венах кровь быстрее побежит при мышечной нагрузке.
По той же причине не рекомендуется резко вскакивать с постели- голова закружиться может. Потому что стенки кровеносным сосудов еще не сокращаются так, как надо в "проснувшемся состоянии.